白巳津川市。学園都市であること以外になんの特色もない街。 大地震により、白蛇九十九神社に祀られていた神器が破損し、 並行世界から所有者に特殊能力を授ける装飾品「アーティファクト」が流入した。 その人知を超えた力を悪用した事件を主人公「新海翔」は、 様々な枝（並行世界）で調査、そして解決してきた。 そしてついに全ての黒幕が「イーリス」だと分かり、 イーリスを倒してくれと「ソフィーティア」にお願いされる。 始まりの日。白蛇九十九神社でフェスを行い大地震により中断されたあの日。 全ての枝の記憶を持った翔は、打倒イーリスのため動き始める。 そして玖方女学院の正義感あふれる少女「結城希亜」の能力、 「ジ・オーダー」がイーリス打倒のカギだと分かり、 翔は希亜に違う枝での出来事を打ち明ける。 アーティファクト流出の真相。魔眼のユーザーとの決着。 異能の力を手に入れた少年少女たちの運命は――。