无处可去的有坂秋樱里，像是迷路一般来到了美滨学园。 在“杀手培训学校”教员这一特殊处境下，她已经度过了三个月。 有坂本应努力适应环境，与学生相依相伴，然而学园却给出了严厉的评价。 “谦虚、笨拙但认真，对任何事都热心且真诚地面对……” “虽然我认为她是个好老师，但现实是，光凭这些可无法胜任美滨的教职。” 有坂巡视学园，通过与自幼作为“杀手”被培养的少女们对话，重新审视自己。 ──就在这过程中。那如锈迹般侵蚀心灵的噩梦再次复苏── 在“杀人魔之家”里，如同蚕茧般封闭内心的少女。 啊，好可怕。 外面的世界好可怕…… 我该怎么办？ 怎样才能得到原谅？ 我做了什么？请原谅我…… 有坂面临人生中最大的决断时刻。 “即便如此，你还要继续这份工作吗？” 她所选择的世界究竟是──。

与往常无异的日常风景—— 在其内部，少女们静静地磨着利牙。 就连哈鲁特也不例外。 他也手持刀具，为“那个时刻”做着准备。 远方，传来声音——呼唤声在回响。 CIRS及SORD全部队被召集，这是前所未有的大规模作战。 迎击的对手是，缘尼西和克洛伊所隶属的宗教组织TFA（The Fatal Answer）。 有坂秋樱里在迷惘。 是否应该将年幼的孩子们送上战场？ 学生们的命运，被托付于她的判断。 作为组织的一员，作为一个人，有坂为此苦恼着—— “有坂老师，您有即使杀死别人也想要保护的东西吗？” “这本小小的手帐，大概会成为我的遗物吧。” “这份经验，终将能拯救某人的性命！” “如果敌对势力中有‘孩子’，您能开枪吗？” “请别后悔哦？” “总比什么都不做而后悔要好！” 在各自的心思火花四溅的战场上，有坂眼中所映出的光景究竟是—— “我曾以为自己见过无数次地狱， 但现在我觉得，我所见过的那些根本算不上地狱。”