理想と現実の間で迷いながら、フリーランスの退魔士として、
人々からの依頼を受けて働く若者、"南雲祐馬(なぐもゆうま)"。
ひょんなことから退魔の力を得た幼馴染みの"鏑木紫(かぶらぎゆかり)"、
最初は紫が戦うのには反対だった佑馬だが紆余曲折を経て共に稲黍(いなきび)村を拠点にして退魔の活動している。
そして、祐馬と縁のある雉杜(きじもり)神社の退魔巫女、
"犬童ちはや(いぬどうちはや)"も修行の一環として二人の助っ人として加わり、
三人での新たな活動の日々が始まった。
次々に飛び込んでくる依頼の数々を、三人は力を合わせて解決し、
人々の暮らしの安寧を守っていく。
だがその行く手には、恐るべき脅威が立ちはだかっていた──