青山剛昌の人気漫画『名探偵コナン』を元にしたゲームの一作。ワンダースワンで発売された三部作の第一作目。
当時最新作だった映画『世紀末の魔術師』とコラボしており、シナリオにも若干同作がらみの話がある。