主人公・久神　暁人（クガミ・アキト）は、人付き合いが苦手で、口数少ない十七歳の少年。
彼に近づく友人は少なかったが、問題児として特に目立つこともなく、
暁人はごく普通の生徒として、変わらぬ日常を過ごしていた。
しかしある日、暁人はそれまで在籍していた学校を、降って湧いたような不祥事により退学となる。
兄のはからいにより、暁人は
最新のハイテク設備を有した新設校として有名な、私立八尋学園（やひろがくえん）に
季節はずれの転校生として転入することになる。
平穏なその学園に奇怪な事件が起こり始めたのは、主人公が転入した直後からだった。
夜の校内を徘徊する異形の影。
主人公の命を狙う謎の少年と、主人公の危機を度々救う不思議なもう一人の少年。
やがて、暁人の前に徐々にその姿を現す、妖しの者たちの影。
彼らが崇める古の存在。
主人公は己を巡る人々と共に、事件の渦中へと否応なしに叩き込まれる。　
やがて訪れる結末の刻、主人公の運命は――？