忌島祐介（いみしまゆうすけ）は、少女から『紅い石』を託される夢を見る。
夢を見た翌日、夜の闇のような不思議な魅力を持った少女、暦川夜（こよみがわよる）が転校して来た。
『紅い蝋石』を探しているという夜は、祐介がいつも身につけている母親の形見の『石』を見せて欲しいと言うのだった。
その前後、まるで暦川夜の存在に呼応するかのように、祈岩町周辺で忌まわしい事件や事故が次々と起こり始める。
その度に『石』は禍々しい輝きを増し、祐介の掌の中で静かに脈動するのだった。
『紅い蝋石』とは何か…、暦川夜の正体とは…。