梅雨の合間、少し控えめな日差しが桜並木を縫って湿った石畳を優しく照らしている。昨夜の雨に濡れた桜の青葉が雫をきらきらと光らせながら、鮮やかな緑色を透かして揺れている。校舎までの短い桜並木に、少女達の黄色い笑い声と軽い靴音が弾むように響いている。その光景は、とても清純で美しく、清々しい。 でも…どうしてボクが通わなきゃいけないのっ？！ 鏑木財閥の御曹司で、文武両道・天稟の才があるけどちょっと気の弱い男の子。そんな瑞穂のもとへ、ある日顧問弁護士が訪れる。 『先だって亡くなられたお祖父様の遺言です』 そう言って渡されたのは、なんと女学院の入学案内。幼なじみ・まりやの趣味で女装を強要させられたあげく、無理矢理転入させられた女学院では、なんの間違いか全校生徒の憧れの的『エルダー・シスター』に選出されてしまう。 突然嵐のように降って湧いた、お嬢さま学院での大騒動！！瑞穂は一体どうなってしまうのか…？！

──世界は、静かに終末を迎えようとしている。 西暦2022年。世界は原因不明の死に至る病に冒されていた。隣接する多重次元世界が融合し、異空間化してしまうという「散花蝕」と呼ばれる時空融合現象である。 汚染地域は人間が近寄ることを頑なに拒み、その領域は徐々に拡大しつつあった……。 そんなある日。九州の片田舎で普通の学生として生きていた「丸目蔵人」は文部科学省の発行した召喚状で、突如として、東京湾の新規埋め立て地に造成された新東雲学園都市に連れてこられることになった。自分にどんな役割があるのか、それにどんな意味があるのか…全く知ることの無いままに。 けれど、刻一刻とそれを許さぬように世界は滅亡への道を辿り始める。 手に携えるは幼い頃から鍛え続けてきた剣術と、一振りの刀剣のみ。 そして蔵人は、そこで自らの運命をそれぞれに斬り拓こうとする少女たちと出逢う──。 逃れる術のない蒼き天蓋の下で──今、少年少女達の未来への戦い、 「終末幻想」の物語が静かに幕を開けようとしていた……。

家族をA.Iの誤作動による事件で亡くして以来、その類のものに忌避感を持つ主人公は、QCショットと呼ばれる競技のプロ選手として生計を立てていた。 一方で学生生活は、幼馴染の【柚子】、悪友の【虎太郎】、【竜平】のおかげで、誰からも好かれる、という訳ではないが、可も無ければ不可も無い、それなりの生活を送ることが出来ていた。 そんな折、【柚子】から、彼女の友人である【千冬】のボディガードをして欲しいという頼み事を受けることになる。どうやら彼女は最近ストーカーらしき男の視線を感じていて、それにひどく怯えているようであったが、主人公はそのストーカーに一種疑問のようなものを抱いていた。 それと時を同じくして、主人公の下に突如厄介者が舞い込むことになる。 彼女の名前は【リップル】。ふとした理由で主人公と生活を共にすることになった彼女は一体何者なのか…？ そして【千冬】を付け狙う男の目的は…？

稲継魂神社に見守られた古町八阿多。 その中心に佇む学園では、古くから生徒達の間で七つの不思議な出来事が語り継がれている。 喋る子狐達から主と呼ばれる八千古島蓮は、子狐達を生み出した妖の少女と幼馴染みである他は、何の変哲もない小柄な男子生徒でしかない。 けれど遠い国から降り立った魔女との出会いを契機として、 八阿多の不思議に少しだけ触れることになる。 高所恐怖症の魔女エリン、 神として祀られる狐の妖月砂、 義妹の華、 幼馴染みの姉深雨、 そしてこの夏新たに出会った女の子達――。 梅雨も早々に明けた太陽の下、夏休みを間近に控えた八阿多学園で、七つの不思議と七つの恋の物語がいま始まる…