少女の夢と願いを込めて 少年たちは空を目指す 主人公・天野翔（あまのかける）は、瑞鳳学園に通う平凡な少年。いつものように登校した翔は、思わぬ荒唐無稽な光景に愕然とする。 なんと学園が玩具の兵隊に占拠され、巨大な檻と化していたのだ。とまどう翔たち七人の男女の前に現れた謎のへっぽこテロリスト少女・かりん。 彼女は威風堂々と彼らの前に立ち、こう告げた。 「あぅ……すみません、この学園は占拠しちゃいました。死にたくなければ、1ヶ月以内に空を飛んでください」 そうして、誰も知らない…… けれど、どこにでもある夏が、始まろうとしていた。

日本の遥か南西に位置する常夏の孤島・月読島（つくよみじま）。 主人公である芳乃零二（よしの れいじ） は、その島に住む いたって普通の学生――“だった”。 突如として非現実的な窮地に陥った零二を救ったのは、美しい一人の少女。 彼女こそは 『No.13（ミッシングナンバー・サーティーン）』、古代より伝わる伝説の “戦略破壊魔術兵器”―― 通称 『マホウ』 と呼ばれる、超科学兵器そのものだった。 『戦略破壊魔術兵器（マホウ）』 の形状は、その人物を象徴するに相応しい形となり、所有者には唯一無二の特殊な “能力（チカラ）” を与えるという。 しかし、彼の使える “能力（チカラ）” は二つ。 「24時間前までに出会っていた人物の召喚」 と、 「物質を24時間前までの状態に戻す」 という、こと兵器や戦争とはかけ離れた能力だった。 そして平和な日常を求める零二の思いとは裏腹に、彼は大切なものを賭けた13人の 『召喚せし者（マホウツカイ）』 たちのバトルロイヤルへと巻き込まれていく。 月読島で繰り返される 『召喚せし者（マホウツカイ）』 たちの哀しき戦いの宿命（れんさ）。 彼が賭けるのは、守るべき大切な日常である、こそばゆい青春の学園生活。 まるで永久に続くダ・カーポのような争いの運命を断ち切るために、零二は今日も戦いの渦中へと飛び込んでいく――…