舞台は、人間世界と妖怪世界の境にある高校。 昼間は人間達が学生生活を送っているが、逢魔時を境に妖怪達の学校に切り替わる。 そのことに、人間は気づいていない……。 主人公は、磯姫の血を引く妖怪。 成績はいいが、強い妖力をもてあましている問題児。 力を発散しなくてはいけないため、悪友と組んで 人のみならず妖怪相手にも悪戯を仕掛けている。 楽しいことが好きで、退屈は嫌い。 妖怪の持つ性質に違和感を持ちながらも、 永遠にも思える、変わらない日常を過ごしていた主人公。 同じ高校に通う相手との恋が、その日常を変えていく——。

人間はその存在にすら気付いていないが、妖怪は街のあちこちに潜んでいる。 主人公は、中でも「死神」という特殊な仕事をしている。 死神は、人間の死を扱うことを仕事とする職業。 会社組織のように開業でき、規模も様々な組織・派閥がある。 主人公は黄泉社という会社に所属しており、 日夜、死神の仕事として人間から命を奪っていた。 しかしある日、殺したはずの藤代巧実がなぜか生きていることを知る。 どうして藤代が生きているのか、その謎を探ろうとする主人公。 謎を突きとめようとすること、また、他の死神達との交流の中で、 今までの殺伐とした日常が変わりだす──。

主人公は、火を自在に操る特殊な竜神の姫であり、半神半妖。 ただし、まだ自分の妖力をうまく制御できず、力の一部を封印している状態。 衣替えをして、主人公は気分も新しく、クラスメイト達と穏やかな日々を過ごしていた。 しかし、物騒な妖の世で、平穏など長続きしない。 とあることから、担任の教師が大怪我をしてしまって……？ 今作は『百鬼夜行〜怪談ロマンス〜』の続編にあたり、 主人公がキャラクター達と恋人同士、あるいは恋人一歩手前という状態からスタート。 以前よりもキャラクター達との距離が近いため、前作以上に恋愛度の高いイベントが楽しめます。