この宇宙の創生期からの敵・エレボスとの戦いから2年の時が経った。
世界を救った主人公と仲間たちはそれぞれの道を歩んでいたが、
主人公のカルディナ大学進学をきっかけに再会を果たす。
その頃アルカディアでは、二つのある異変が起きていた。
一つは大陸全体の住民の数が急激に増え、村や街が活気に満ち溢れていること。
もう一つは、これまで知られていないモンスターによる被害が
大陸各地で報告されるようになったこと。
一見何の関連もないように思えたこの二つの異変が、
やがて宇宙全体に関わる大きな選択を
主人公に強いることになる。
新たな仲間が加わり、物語は再び動き出す。
主人公の下す決断は
宇宙を、そして愛する人の運命をどう変えるのか——