ある日、主人公の元に小さな女の子が尋ねてきた。彼はその少女を見て驚く。何故なら彼女は幼い頃、主人公とよく一緒に遊んだ女の子だったからだ。自分のことを『魔女』だと語る彼女は、幼い頃主人公と一緒によく魔法を使って遊んでいたが、不老長寿の魔術を二人で行った際に失敗して、成長が止まってしまったのだという。彼女は彼に、自分の成長を元に戻し、魔女として一人前に認めてもらうよう協力して欲しいとお願いする。主人公は、彼女のお願いを断われず、協力を承知する。だが彼には不安があった。近くに住む彼を「お兄ちゃん」と慕う小さな退魔師・・・陰陽師の女の子。彼女が、どんな理由があれ魔女という存在を許すだろうか・・・？
そして、彼の不安は的中する。陰陽師娘が、魔女がやって来た理由と協力することを知ると「お兄ちゃんにそんな危ないことはさせない！」と怒る。お互い睨みあい、一触即発の状態に・・・。
こうして魔女が元に戻るための儀式を行うまでの間、主人公を巡って女の子二人の奇妙な同棲生活へと発展していくのだった。