遠き昔荒ぶる鬼神を封印したという伝承のある霊峰『怨室ノ峰』。

古の呪い故か、千年以上も前から怨室ノ峰周辺には今現在に至る長きにわたって物の怪による様々な怪奇事件が頻発していた。
怨室ノ峰の僧達は、そんなあやかしや百鬼夜行を調伏せんが為に戦う法術のエキスパート。
『退魔師』である。

彼らの存在により、今まで妖魔の影響が霊峰の外に出ることは無かったのだが…。
主人公「天真郷志郎」はそんな妖魔たちを調伏する者の一人。
ひとたび事件が起これば法術を駆使し妖魔を祓う「退魔師」として戦いに身を投じることとなる。
そんな彼の傍らにはいつも、妹分「岩倉百音」そして二人の姉代わりの勧請師「出水睦那」という二人の女性がついていた。

三人の周囲に巻き起こる数々の事件…。
その中に垣間見る狂おしくも哀しい人の思い…。
そして、日々弱まりつつある鬼神の封印…。

時に激しく、時に哀しい戦いの中で浮かび上がるそれぞれの「因縁」。
その戦いの果てに、彼らを待ち受けているものは…。