異端の科学者フリッツ・ウォーレン博士が生み出した、人間の知能と動物の身体能力をあわせ持った生物兵器を作り出すウイルス「クラブHT1」。 その研究は、ウォーレン博士が自身の作り出した生物兵器によって殺されるという結果をもって頓挫したかに見えた。 しかし、研究成果を回収した「伊集院財閥」によ り、密かに研究は続けられていくことになる。

『パンドラの森』から数百年後の世界 さらに時は流れ、森に浸食されたドームシティは次々に崩壊、地上では変異体が繁栄を謳歌し、人類を忘れ去った。 しかし、生き残った人類は地下にシェルターを建設、そこから変異体を排除し地上を再び人類の手に取り戻す計画が、密かに進められていた…。