強力な伝染病の流行で、一度は滅びかけた世界。数十年間の無政府状態と暗黒時代を経て人類は国家と文明を取り戻したが、科学技術や文化的成熟は大きく後退することになった。そして、日本においても新たな政府統治による『新世界歴』が始まって50余年が経過した頃、隣国『大陸連合』との戦争が始まった。
２年間の泥沼の戦争状態。大規模な作戦を行う余裕のない日本。ヨーロッパ方面にも不安を抱え、戦力を大規模投入できない大陸連合。小競り合いの続く中、戦争という極限状態にあって、技術革新だけは着々と進んでいった。
主人公は新兵器実験部隊の小隊長を命じられ、素人同然の５人の女性兵士を部下に与えられる。命令は富士山麓の基地から最前線・北海道まで新兵器の稼働データを取ること、そして途中、本土に侵入しているゲリラを掃討し実戦データを取ること。
無謀ともいえる指令の特権として、主人公は「隊員はすべて、隊長のあらゆる命令に従う契約を済ませており、よって隊員からのあらゆるクレームを上層部は無視する」という約束を与えられる。これを利用して鬼のスパルタ教育でエリート部隊を育て上げるか、セクハラ三昧でハーレム部隊にしてしまうかは、ユーザー次第となる。