海底都市ブルージェネシスに怪物・ナイトメアの噂が流れる。それは世界崩壊の予兆をはらんだ真実だった。謎の生命体と合体後、覚醒する。覚醒後、戦う力を持った高校生・片山弘樹（主人公）は自分と同様に覚醒した仲間を謎の生命体とともに探すが...