平和な毎日を過ごしていた主人公・ノナカロクスケの元に突如、魔法世界からやってきたという見習い魔女・ニーが現れた。あろうことか、そのまま主人公の元に住み着いてしまった。しかも、主人公だけではない。幼なじみのメグミの元にはポニカが、同級生のキシオの元にはドリルが居候を始めていた…。
遥か遠い昔、魔法使いと人間はひとつの世界に共存していた。しかし考え方の違いから深まった溝は、いつしか越えられない物になってしまった。魔法使いの偉大な力を恐れた人間は、彼らの存在をこの世から消 そうとした。魔法使いは人間達に絶望し、逃げ場を求めた。その様子を見ていた神は魔法世界を作り上げ、魔法使い達を移住するように促した。こうして魔法使いは魔法世界に移り住み、人間との交流を絶った。それから数百年の時の間、魔法使いたちはひそかに修行にため人間界にきていました。今年もひそかに見習いたちの魔法使いになるための修行「魔女のお茶会」が開かれようとっしていました。