高齢のため東京に住む両親との同居を決めた祖母と入れ替わり、瀬戸内海に面する田舎町、天水町（あまみちょう）で一人暮らしを始めた主人公。天水町は小さい頃から夏冬の休みの度に遊びに来ていた思い出の地であった。
隣に住む同い年の幼馴染、連絡を取り合っていた生徒会長との再会。神社の巫女である先輩。そして主人公に続いて天水町へきた妹。穏やかで、そして楽しい学園生活は続くかと思われた。
そんなある日、神を名乗る女の子が彼らの前に現れ、主人公の家に押し掛けてきた。