西洋の町並みと、現代の日本の町並みが入り交じった街『シブヤ』。
その建物の間の裏路地で、ゴミ捨て場に倒れていた少年－ジュンナ－が目を覚ます。
ジュンナは、いったい自分は誰なのか？　なぜここにいるのか？　ここは何処なのか？
……自分の事が、全くわからなかった。
狼狽する彼の前に、静かに浮かぶ、ヒナと名乗る少女が自分の目の前に現れる。
彼女の「探して……」という言葉に、「何を？」と尋ねるも、急に近づいてくる走る足音に彼女の姿は壁の中に消えてしまう。
ジュンナが足音の方を振り向くと、流れるような銀髪。黒く風に舞う外套をまとう一人の男とすれ違う。彼と目があった瞬間。
彼の心の中に浮かび上がるのは、郷愁にも似た感情。
月明かりに消えたマントの男アルスタット。
アルスタットを追う刑事タガミ。
少年が出会った人形師タスク。
記憶を失っているジュンナは、ヒナの言葉に、あてもなく「何か」を探しはじめる。
アルスタットは、殺人現場から逃げたという。
出会った友人ハルヒの先輩キサラが血の海に倒れ、真相を追うジュンナに迫ってくる危険。やがてその魔手は、確実にジュンナへ目標を定める。
この街で起こる殺人事件の真相とは？
失われたジュンナの記憶は……？
ヒナが探し求める『何か』とは？