榊水緒（さかき・みお）は、ごく普通の高校生。
……だけれど、祖母に育てられた影響か、やや古風なところもあり、
同世代の女の子たちからは浮いてしまいがち。
相手の気持ちを考えすぎて、しばしば何も言えなくなってしまう。
『勘がいい』と言われることもあったが、今まで、それを深く気にしたことはなかった。
ある日の夕暮れ。少女は逢魔が刻に『神隠し』に遭い、
幽世（かくりよ）――隔絶された常夜の国へ迷い込む。
この世ならざる者たちが行き交う異世界で、少女は様々な『命』と出逢う。
幽世の和を乱す妖怪を狩り、世界の秩序を守る『鎮守学舎』に招き入れられた少女は、
やがて現世と幽世、双方の世界を揺るがす事件に巻き込まれていく。