ないしょの放課後

主人公、真城有哉（しんじょう・ゆうや）は、顔がちょっと女の子っぽいことをのぞけば、どこにでもいるような、ごくふつうの少年。両親は仕事で不在がちで、ひとりで過ごすことには慣れている。くわえて隣の家におじさん夫婦といとこのみそのが住んでいてなにかと面倒を見てくれるので、不自由を感じたことはない。クラスメイトの親友・なみや、ひとつ年下で自分を慕ってくれるかわいい後輩・さくらに囲まれて、おだやかながらもそれなりに幸せで楽しい一般的な学園生活を送っていたが、有哉にはしばらく前から周りには内緒にしているひとつの秘密があった。
それは、しばらく前からいとこの、みそのとエッチな関係を持ってしまっているということ。みそのとのエッチを皮切りに、有哉の「そういうこと」への興味は年頃が年頃だけに、どんどん大きくなっていく。いままでは「そういう目」で見てこなかった、さくらやなみを、有哉はだんだん異性として意識しはじめる…。