主人公·冬马庄一郎正打算以转学为契机告别御宅族身份之际，却遭到妹妹·琴未的阻挠，被转入了御宅族们聚集的“私立秋叶原学园（通称‘秋学’）”。他在关系变好的同班同学的邀请下，前往名为“二次元美少女研究部”的社团活动。