Kahoko Hino is a student at a Seisou Academy, one with an ordinary life. One day, Lili - the mischievous musical fairy who had blessed the original founder of the school - finds Kahoko running late to class. Delighted that she is able to see him, Lili grants Kahoko a magical violin, and a place in the school's annual musical competition, which many students in the music department vie to partake in. Kahoko refuses, only to be pressed on by the fairy, who constantly nags her until she finally gives way to his pleads. She reluctantly accepts the instrument. As she practices her pieces, Kahoko is amazed that she can play any piece on the violin as long as she knows the tune and plays it with her heart. [From [url=http://en.wikipedia.org/wiki/Kiniro_no_Corda]Wikipedia[/url]]

『２』のその後の物語として、三学期に入り、３年生の卒業を間近に控えた星奏学院を舞台に新たなストーリーが展開。バレンタインデーなどこの時期ならではのイベントもあり、新鮮な気持ちでプレイできます。 男子生徒たちは新たな私服で登場し、女子生徒たちも初めて私服姿を披露しています。

前作の『金色のコルダ』から8年が経過した設定。担当声優の大半が引き続き起用されているが、登場人物は一新した。また、学院内で起こる出来事や恋愛がメインだった前作と異なり、今回は同校の生徒に留まらず、全国から集まる他校のライバル達の攻略も可能となっている。 主人公・小日向かなでは、小さい頃からヴァイオリンを習いながらも、思うように弾けず伸び悩む日々を送っていた。ある日、出場した発表会での演奏後、彼女に一通の手紙が渡される。差出人不明のそれに書かれた言葉により、触発された主人公は、幼馴染が通う音楽教育で名高い星奏学院への転校を決意。もう1人の幼馴染とともにオーケストラ部に入り、選抜を勝ち抜き、室内楽部門の全国優勝を目指すことになった。

――2人のヒロインの視点でそれぞれ描かれる、妖精の島での冒険ストーリー ある晩のこと――主人公とその仲間は 夢の中で突然、見知らぬ島に呼び出される 日野香穂子は音楽の妖精・ファータの住む不思議な島「ハルモニア」に 小日向かなではその沖合にある小さな無人島「猫島」に 自分たちはなんのために呼ばれたのか 元の世界には戻れるのか 謎を探るうちに主人公は次第に島の危機に関わるようになり、妖精たちを救うため 別の時代から来た演奏者とも協力することに 紡がれる新たな絆と、かけがえのない想い 彼らは妖精の島を救えるのか？ 音楽の奇跡は、果たして――