両親の仕事の都合で転校してきた主人公が学校の旧校舎で謎の掛け軸と不思議な黒猫と出会った事で始まるストーリー。
掛け軸は「十二の書」と呼ばれていて中には力を持った十二体の魔と呼ばれる妖がいたのが、主人公が触れたことで開放されてしまう。
十二の書の主に選ばれた主人公は書の番人である黒猫「二つ尾」に頼まれて散りじりになってしまった十二体の魔を探し出して封印することに。
そこで出会う書を回収するために転校してきた陰陽師とかスキンシップ過剰なクラスメイトや、おやじくさい先生、不思議な下級生など様々な人たちと交流しながら主人公は今まで縁のなかった妖の世界に巻き込まれていく。